pymod:PyMod 3-PyMOL中的序列相似性搜索，多个序列结构比对和同源性建模

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文件名称：pymod:PyMod 3-PyMOL中的序列相似性搜索，多个序列结构比对和同源性建模
文件大小：1.47MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-24 09:05:59
bioinformatics pymol-plugin pymol protein-sequences sequence-alignments PyMod 3 PyMod 3是一个开源插件，旨在充当PyMOL与多种生物信息学工具（例如BLAST +，HMMER，Clustal Omega，MUSCLE，PSIPRED和MODELLER）之间的接口。 当前的PyMod版本PyMod 3与最新的PyMOL版本兼容（请参见下面的“需求”部分），并对其前身（PyMod 2）进行了新功能扩展。 从靶蛋白的氨基酸序列开始，用户可以利用PyMod 3进行同源性建模过程的三个步骤（即模板搜索，靶标-模板序列比对和模型构建），以构建一个目标蛋白质（或蛋白质复合物）的3D原子模型。 另外，PyMod 3也可以在同源性建模环境之外使用，以扩展具有许多类型功能的PyMOL。 序列相似性搜索，多个序列/结构比对建立，进化保守性分析，域解析和循环建模可以在PyMod 3 / PyMOL环境中执行。 要求 PyMod 3已经过测试，可以在Windows，ma