flex:使用多个序列比对工具的共识序列管道

时间:2021-07-07 18:11:34
【文件属性】:
文件名称:flex:使用多个序列比对工具的共识序列管道
文件大小:4KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-07-07 18:11:34
Python 要求: 用法: find_mapped_reads.py 返回一个仅包含映射指定区域内读取的 fasta 文件。 python3 find_mapped_reads.py [fasta file with reads] [m5 mapping output from blasr] [start index] [end index] [output file name] 示例: python3 find_mapped_reads.py reads.fa mapping.m5 100 5100 reads_100_5100.fa flex.py 从多序列比对输出创建一致序列。 python3 flex.py [fasta file output from Muscle] [minimum number of non-gap nucleotides] [nucleotide pe
【文件预览】:
flex-master
----flex.py(1KB)
----get_backbone_region.py(341B)
----read_fasta.py(2KB)
----.gitignore(10B)
----find_mapped_reads.py(2KB)
----README.md(1KB)

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