infernal:RNA二级结构序列图用于同源性搜索和比对

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文件名称：infernal:RNA二级结构序列图用于同源性搜索和比对
文件大小：19.25MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-10 15:37:58
C 地狱-RNA二级结构比对的推断 是协方差模型（CM）的实现，协方差模型是RNA二级结构和序列共有序列的统计模型。 您为Infernal提供了保守结构RNA家族的多序列比对，并标注了共有的二级结构。 “ cmbuild”程序将建立您的路线的统计资料。 该CM可用作数据库搜索中的查询，以查找您的RNA的更多同源物（“ cmsearch”程序）。 您还可以使用序列家族代表性比对的CM来创建任意数量的RNA的更大的共有比对（“ cmalign”程序）。 Infernal是Rfam RNA数据库（ ）的软件引擎。 要获取Infernal版本，请访问 。 要参与地狱开发，请访问 。 地狱的发展取决于上的HMMER软件包。 和Easel库，也位于。 下载并构建当前的源代码版本： % wget http://eddylab.org/software/infernal/infernal.tar.