consalifold:RNA共识二级结构的预测工具,以考虑RNA成对的结构比对

时间:2024-03-09 03:20:22
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文件名称:consalifold:RNA共识二级结构的预测工具,以考虑RNA成对的结构比对

文件大小:3.45MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-03-09 03:20:22

Python

RNA共识二级结构的预测工具,以考虑RNA成对的结构比对 安装 该项目主要用Rust(一种系统编程语言)编写。 您需要安装Rust组件,即rustc(Rust编译器),cargo(Rust包管理器)和Rust标准库。 访问,了解有关Rust的更多信息。 您可以使用以下一行来安装Rust组件: $ curl --proto ' =https ' --tlsv1.2 -sSf https://sh.rustup.rs | sh 上面的安装由完成,Rustup可以轻松切换使用中的编译器。 作为ConsAlifold的依赖项,您需要安装和 。 您可以按以下方式安装ConsAlifold: $ RUSTFLAGS= ' --emit asm -C target-feature=+avx -C target-feature=+sse -C target-feature=+mmx ' cargo


【文件预览】:
consalifold-master
----Cargo.toml(477B)
----src()
--------sample_rnas.py(550B)
--------main.rs(17KB)
--------utils.py(5KB)
--------run_css_estimation_programs.py(25KB)
--------run_all.py(384B)
--------get_trna_prob_dists.py(1KB)
--------get_stats_of_css_estimation_programs.py(55KB)
--------lib.rs(3KB)
--------compile_rna_fams.py(3KB)
----assets()
--------trna.fa(88KB)
--------sampled_trnas.fa(587B)
--------rfam_seed_stas_v14.3.sth(19.94MB)
----README.md(2KB)
----.gitignore(121B)

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