文件名称：assembly_improvement:通过脚手架和间隙填充提高 denovo 组装的质量
文件大小：2.86MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-19 04:12:09
bioinformatics research genomics pathogen sequencing
装配改进 以 FASTA 格式接收程序集，以 FASTQ 格式读取，并通过脚手架和间隙填充使程序集更好。 内容 order_contigs_with_abacas read_correction_with_sga remove_primers_with_quasr rename_contigs scaffold_with_sspace 执照 反馈/问题 引文 介绍 该软件采用 FASTA 格式的程序集以及 FATSQ 格式的读取，并通过脚手架和间隙填充来改进程序集。 该软件包含几个单独的脚本，其中包括prepare_assembly，descaffold_assembly，diginorm_with_khmer，fastq_tools，order_contigs_with_abacas，read_correction_with_sga，remove_primers_wi