rampart:实时读取分配,映射和系统发育分析

时间:2024-06-15 09:29:20
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文件名称:rampart:实时读取分配,映射和系统发育分析

文件大小:26.5MB

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更新时间:2024-06-15 09:29:20

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壁垒 实时读取分配,映射和系统发育分析。 RAMPART与MinKNOW同时运行,并向您实时显示解复用/映射结果。 动机 时间对于爆发分析至关重要,并且测序准备工作的最新进展现在意味着测序是许多病原体的瓶颈。 此外,许多病原体的体积很小,意味着可以在几分钟之内获得有洞察力的序列数据。 RAMPART与此类病原体的MinION测序同时运行。 它提供了每个条形码的基因组覆盖率和参考匹配的实时概览。 RAMPART最初旨在与基于扩增子的引物方案(例如 )一起使用,但这不是必需的。 文献资料 地位 RAMPART正在开发中,即将出版。 如有任何问题,疑问或意见,请。 已将RAMPART部署为顺序:


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