【文件属性】:
文件名称:matlabauc代码-WLDAP:该软件包实现了WLDAP算法,可预测lncRNA-疾病关联
文件大小:311KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-24 09:59:37
系统开源
Matlab的耳语WLDAP
执照
版权所有(C)2019
LiFeng
Wu(),Guobo
Xie()
分发该程序是希望它会有用,但是没有任何保证;
甚至没有对适销性或特定用途适用性的暗示保证。
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类型:包标题:WLDAP:加权lncRNA-疾病关联预测的计算模型
Description(说明):该程序包实现WLDAP算法,预测lncRNA-疾病关联。
要求
8GB内存MATLAB
R2017a或更高版本
相关数据信息需要先加载
known_lncRNA_disease_interaction_1.txt:在我们的方法中,已知lncRNA-疾病关联由邻接矩阵A表示,该矩阵显示疾病与lncRNA之间的二元关联。1代表疾病j与lncRNA
i关联,否则为0。该数据集包括115个lncRNA和178个疾病,具有540种经过实验验证的关联。
然后是比较数据集,即lncRNA_Disease_Matrix_2.txt
,
know_dis_lncRNA_3.txt
相关
【文件预览】:
WLDAP-master
----data()
--------known_lncRNA_disease_interaction_1.txt(40KB)
--------know_dis_lncRNA_3.txt(139KB)
--------~$dataset1_最终得分矩阵.xlsx(165B)
--------lncRNA_Disease_Matrix_2.txt(36KB)
----code()
--------pre_label_score_WLDAP_5fold.mat(44KB)
--------WLDAP.m(1KB)
--------known_lncRNA_disease_interaction_1.txt(40KB)
--------new_gaussiansimilarity.m(1KB)
--------know_dis_lncRNA_3.txt(139KB)
--------WLDAP_5fold.m(2KB)
--------roc.m(382B)
--------Sim_dis.m(292B)
--------lncRNA_Disease_Matrix_2.txt(36KB)
--------pre_label_score_WLDAP_LOOCV.mat(249KB)
--------get_interaction.m(445B)
--------param_tune_loocv.m(1KB)
--------duibi.m(737B)
--------WLDAP_LOOCV.m(1KB)
--------Sim_lnc.m(201B)
----LICENSE(18KB)
----README.md(3KB)