matlabauc代码-WLDAP:该软件包实现了WLDAP算法,可预测lncRNA-疾病关联

时间:2024-06-13 03:46:17
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文件名称:matlabauc代码-WLDAP:该软件包实现了WLDAP算法,可预测lncRNA-疾病关联

文件大小:311KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-13 03:46:17

系统开源

Matlab的耳语WLDAP 执照 版权所有(C)2019 LiFeng Wu(),Guobo Xie() 分发该程序是希望它会有用,但是没有任何保证; 甚至没有对适销性或特定用途适用性的暗示保证。 有关更多详细信息,请参见GNU通用公共许可证。 您应该已经与该程序一起收到了GNU通用公共许可证的副本; 如果不是,请参见。 类型:包标题:WLDAP:加权lncRNA-疾病关联预测的计算模型 Description(说明):该程序包实现WLDAP算法,预测lncRNA-疾病关联。 要求 8GB内存MATLAB R2017a或更高版本 相关数据信息需要先加载 known_lncRNA_disease_interaction_1.txt:在我们的方法中,已知lncRNA-疾病关联由邻接矩阵A表示,该矩阵显示疾病与lncRNA之间的二元关联。1代表疾病j与lncRNA i关联,否则为0。该数据集包括115个lncRNA和178个疾病,具有540种经过实验验证的关联。 然后是比较数据集,即lncRNA_Disease_Matrix_2.txt , know_dis_lncRNA_3.txt 相关


【文件预览】:
WLDAP-master
----data()
--------known_lncRNA_disease_interaction_1.txt(40KB)
--------know_dis_lncRNA_3.txt(139KB)
--------~$dataset1_最终得分矩阵.xlsx(165B)
--------lncRNA_Disease_Matrix_2.txt(36KB)
----code()
--------pre_label_score_WLDAP_5fold.mat(44KB)
--------WLDAP.m(1KB)
--------known_lncRNA_disease_interaction_1.txt(40KB)
--------new_gaussiansimilarity.m(1KB)
--------know_dis_lncRNA_3.txt(139KB)
--------WLDAP_5fold.m(2KB)
--------roc.m(382B)
--------Sim_dis.m(292B)
--------lncRNA_Disease_Matrix_2.txt(36KB)
--------pre_label_score_WLDAP_LOOCV.mat(249KB)
--------get_interaction.m(445B)
--------param_tune_loocv.m(1KB)
--------duibi.m(737B)
--------WLDAP_LOOCV.m(1KB)
--------Sim_lnc.m(201B)
----LICENSE(18KB)
----README.md(3KB)

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