文件名称：matlabauc代码-BiRW:双随机游动的表型-基因关联预测
文件大小：3KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-13 03:53:27
系统开源
Matlab的耳语BiRW 双随机行走表型-基因关联预测。 只需在matlab中运行“ birw_mn_main”即可。 将执行具有默认参数（alpha = 0.8，m = 4和n = 4）的算法BiRW，并且还可以执行评估，可以显示平均AUC分数最高为50、100、300、500、1000以及全部。 您也可以在“ birw_mn_main.m”中更改参数。 文件列表：“ birw_mn_main.m”在此脚本文件中调用源代码的主要条目，BiRW算法和评估过程。 “ birw_mn.m”在该函数中实现算法BiRW“ roc_test_eval.m”在OMIM May-2010中具有新关联的评估（g_p_network_emerge.mat），并由birw_mn_main.m调用。“ ROC.m” AUC函数用于排名列表，并由roc_eval.m调用 数据文件：“ phenotype_logistic.mat”表型相似性网络用作表型网络。 基于van Driel 2006的表型相似度矩阵，使用逻辑函数将相似度评分转换为逻辑评分。 “ ppi_network.mat”蛋白质-蛋白质相互作用
【文件预览】：
BiRW-master
----birw_mn.m(1KB)
----ROC.m(645B)
----roc_test_eval.m(1KB)
----birw_mn_main.m(1KB)
----README.md(2KB)