NDAMDA网络距离分析，用于MiRNA疾病关联预测

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文件名称：NDAMDA网络距离分析，用于MiRNA疾病关联预测
文件大小：459KB
文件格式：PDF
更新时间：2021-04-11 22:51:06
adjusted network distance, association prediction, 近年来，随着越来越多的研究表明，miRNA在各种基本生物学过程中发挥着重要作用，并且miRNA的失调与多种人类疾病（尤其是癌症）相关，microRNA（miRNA）引起了越来越多的研究者的注意。 然而，用于鉴定miRNA与疾病之间联系的实验方法仍然昂贵且费力。 在这项研究中，我们开发了一种称为网络距离的计算方法。MiRNA-疾病关联预测分析（NDAMDA）可以有效地预测潜在的miRNA-疾病关联。 该方法的亮点是不仅使用2个miRNA（疾病）之间的直接网络距离，而且还使用它们与网络中所有其他miRNA（疾病）的平均网络距离。 该模型的可靠性能得到了全球一次性留出交叉验证（LOOCV）为0.8920的AUC，本地LOOCV为0.8062的五倍交叉验证的平均AUC为0.8935 0.0009的认证。 此外，我们将NDAMDA应用于3个不同的案例研究，以预测与乳腺肿瘤，淋巴瘤，食道肿瘤，前列腺肿瘤和肝细胞癌相关的潜在miRNA。 结果表明，前50种预测的miRNA的86％，72％，86％，86％和84％得到了实验关联证据的支持。因此，NDAMDA是一种预测疾病相关miRNA的可靠方法。