【文件属性】:
文件名称:数据融合matlab代码-BIRWMDA:融合多个生物网络以有效预测miRNA-疾病关联
文件大小:17KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-22 12:16:30
系统开源
数据融合matlab代码融合多个生物网络以有效预测miRNA-疾病关联
数据从以下位置下载:
通过BIRWMDA推断与疾病相关的microRNA
如何使用该工具?
只需运行“
BIRWMDA_predict.m”即可产生结果。
数据集:数据下载:
疾病语义相似度矩阵1.txt:疾病语义相似度1(383×383)
疾病语义相似度矩阵2.txt:疾病语义相似度2(383×383)
功能相似性矩阵.txt:microRNA功能相似性(495×495)
knowndiseasemirnainteraction.txt:已知的microRNA-疾病关联(5430
*
2)
疾病名称.xlsx:所有疾病的ID
miRNA
name.xlsx:所有microRNA的ID
程序:
BIRWMDA_predict.m:运行程序的主界面
高斯相似度.m:计算microRNA和疾病的高斯相互作用谱核相似度
SNF.m:融合多种生物信息网络
BIRWMDA.m:随机行走microRNA和疾病相似性网络
Rank.m:与疾病相关的microRNA排序
Write_file.m:将结果写入excel
操作环境:
【文件预览】:
BIRWMDA-master
----normFun.m(486B)
----Write_file.m(308B)
----gaussiansimilarity.m(759B)
----knowndiseasemirnainteraction.txt(38KB)
----README.md(2KB)
----BIRWMDA.m(1KB)
----Rank.m(799B)
----BIRWMDA_Predict.m(1KB)
----SNF.m(1KB)