文件名称：L1-norm-Graph:miRNA-疾病关联预测的新型半监督方法
文件大小：3.23MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-20 04:10:30
R
L1-范数图 基于L1-范数图的miRNA-疾病关联预测的半监督新方法 方法说明： 我们提出了一种新型的半监督模型，以通过l_1-范数图预测miRNA-疾病关联。 具体来说，我们根据最新版本的MeSH描述子和HMDD重新计算了miRNA的功能相似性以及疾病的语义相似性。 然后，我们在miRNA空间和疾病空间中迭代更新相似性矩阵和关联矩阵。 来自每个空间的优化关联矩阵被组合在一起作为最终输出。 方法要求： 由于我们的方法是在R中开发的，因此我们要求用户在其操作系统上安装R-3.4.2（或更高版本）。 用户也可以安装R包“ parallel”以在Linux / Unix / MacOS上并行运行我们的脚本。 用法： 要运行我们的方法，只需在R编程环境或其他R IDE工具（例如RStudio）中打开“ run_prediction.R”脚本，然后按“运行”按钮。 另一个选择是使用命令行格式运
【文件预览】：
L1-norm-Graph-master
----L1_graph.R(1KB)
----miRNA_disease_association.txt(366KB)
----README.md(2KB)
----miR_disease.RData(1.54MB)
----run_prediction.R(1KB)
----miRNA_similarity_score.txt(4.72MB)
----disease_similarity_score.txt(638KB)