疫情matlab代码-VariationalSusceptibility:变异敏感性

时间:2024-06-12 03:47:59
【文件属性】:

文件名称:疫情matlab代码-VariationalSusceptibility:变异敏感性

文件大小:5.46MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-12 03:47:59

系统开源

疫情matlab代码变异敏感性COVID模型的敏感性分析 该存储库包含通过修改Aguas等人的论文中的代码获得的数据和结果。 (2020)。 简而言之,我们测试了在5、10,...,150天的最大社交距离下更改时间量。 我们还测试了将社交距离曲线更改为线性减小,直到达到模拟所结束的最大社交距离的5%,10%,...,100%为止。 最后,我们通过测试120天,240天,...,1440天的下降,对社交距离下降的敏感性进行了敏感性分析。 这种实现的方式是运行Python脚本以为每个参数更改生成一个新文件,并运行bash脚本以在超级计算机的单独节点上运行所有文件。 可以在相应分析文件夹中的codegen文件中看到。 每个测试的所有推断参数都位于结果部分中的相应文件夹中。 此外,我们添加了比利时和英格兰截至8月的数据,这些数据集位于data文件夹中。 为了复制我们的分析,运行codegen了相应的测试要复制的文件。 因此,运行所有生成的Parameter Estimation文件将产生要放入Epidemic MATLAB代码的参数,并查看流行曲线以及$ R_c $和$ R_eff $曲线。


网友评论