文件名称:parasail-python:Parasail C库的Python绑定
文件大小:76KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-12 03:35:08
Python
帆帆蟒 Parasail C库的Python绑定 Travis构建状态: PyPI软件包: 作者:Jeff Daily( ) 目录 文件输入 回溯 引用滑翔伞 许可:Battelle BSD风格 这个软件包包含了Python绑定滑翔伞。 Parasail是一个SIMD C(C99)库,其中包含Smith-Waterman(本地),Needleman-Wunsch(全局)和半全局配对序列比对算法的实现。 安装 回到顶部 使用点 回到顶部 推荐的安装方式是使用可通过pip获得的最新版本。 pip install parasail Windows和OSX的二进制文件应该可以通过pip获得。 在Linux平台上使用pip首先将下载最新版本的parasail C库源代码,然后将其自动编译到共享库中。 要从源代码进行安装,或者要了解pip安装在Linux上的工作方式,请继续阅读。 测验
【文件预览】:
parasail-python-master
----MANIFEST.in(489B)
----.travis.yml(1KB)
----README.rst(19KB)
----parasail()
--------bindings_v2.py(700KB)
--------bindings_v1.py(166KB)
--------__init__.py(3KB)
----tools()
--------ctypesgen.py(21KB)
--------ctypesgen2.py(43KB)
----tests()
--------test_tables.py(5KB)
--------test_ssw.py(839B)
--------test_io.py(3KB)
--------test_matrix.py(740B)
--------test_case.py(2KB)
--------test_basic.py(772B)
--------test_cigar.py(1KB)
----setup.cfg(257B)
----requirements.txt(6B)
----setup.py(17KB)
----.gitignore(85B)
----CHANGELOG.rst(6KB)
----COPYING(2KB)
----DISCLAIMER(1KB)