文件名称：parasail:成对序列比对库
文件大小：3.74MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-19 20:29:32
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parasail：成对序列比对库 特拉维斯（Travis）： AppVeyor： 作者：Jeff Daily（ ） 目录 替代矩阵 SSW库仿真 功能查询 带状全球结盟 文件输入 回溯 语言绑定 C / C ++ Python 锈 Java Windows版本 应用范例 引用滑翔伞 许可：Battelle BSD风格 介绍 回到顶部 parasail是一个SIMD C（C99）库，其中包含Smith-Waterman（本地），Needleman-Wunsch（全局）和各种半全局配对序列比对算法的实现。 在此，半全局意味着在查询或目标序列的开始之前或结束之后的插入（可选）不会受到惩罚。 parasail实现了用于矢量化成对序列比对的最著名算法，包括对角线[Wozniak，1997]，阻塞[Rognes and Seeberg，2000]，条纹[Farrar，2007]和前缀扫