文件名称：UWO241-RNA-Seq-analysis:全球转录组学分析和南极绿色藻类衣藻衣原体UWO241中差异表达的热激蛋白基因
文件大小：531KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-10 20:53:27
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UWO241-RNA-Seq分析 全球转录组学分析和南极绿色藻类衣藻（Chlamydomonas sp。）中的热激蛋白。 UWO241 差异基因表达（DEG），热图和维恩 使用HISAT2将数十亿个UWO241 RNA-seq读图定位到绿藻组装的基因组（参考基因组：GCA_016618255.1），并使用HTSeq-count v0.11.3对预测的基因模型进行计数。 使用Stringtie v2.1.5从HISAT2创建的SAM / BAM文件生成表达式估计。 Samtools v1.11用于读取和写入SAM和BAM文件中的Illumina RNA-seq比对。 为了创建全局转录组变化特别是HSP基因家族的热图，通过基因长度和测序深度将比对读取的总数归一化，以准确估计表达水平。 将这些标准化的读取计数（RPKM）用作每个基因的表达水平，并通过Ballgown v2.22.0和edge
【文件预览】：
UWO241-RNA-Seq-analysis-main
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