文件名称：matlab中拟合中心线的代码-Suite2P:用于处理2P记录的工具
文件大小：2.32MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-09 00:13:44
系统开源
matlab中拟合中心线的代码Suite2p：快速，准确和完整的两光子流水线 配准，细胞检测，峰提取和可视化GUI。 中的算法细节。 该代码由Marius Pachitariu，Carsen Stringer和cortexlab成员（Kenneth Harris和Matteo Carandini）编写。 此处不提供任何担保。 要获得支持，请直接在github上打开一个问题。 对于python版本的代码，请转到。 我们建议使用python代码-文档更好（请参阅参考资料），并且图形界面具有更多功能。 我们还将停止更新matlab版本。 例子 提供了一个示例数据集（带有master_file和make_db）。 一，引言 这是一个完整的自动化管道，用于处理两光子钙成像记录。 它简单，快速，并产生大量的活动ROI。 GUI还提供了点击功能，可在几分钟内完善结果。 该管道包括以下步骤 XY子像素配准：使用相位相关算法的修改和FFT域中的子像素转换。 如果有GPU，则在30Hz和512x512分辨率下，每1小时录制20分钟即可完成一次GPU。 SVD分解：这为细胞检测提供了输入，并加速了算法。 细