文件名称：matlab中拟合中心线的代码-PIPE:管道
文件大小：25KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-09 00:12:07
系统开源
matlab中拟合中心线的代码管道 用于分析光电转换电影的软件包。 此Matlab代码是Rotem Gura Sadovsky在麻省理工学院的Jeremy England博士的实验室中为科学界做出的贡献而开发的。 有关使用和分发准则，请参阅许可证文件。 光转换强度分布扩展（PIPE）可测量活细胞中的蛋白质扩散。 PIPE的工作原理是：使光可转换的荧光蛋白产生脉冲，在脉冲区域产生峰值荧光信号，并在扩散扩散信号时分析信号的空间扩展。 扩展信号的宽度与蛋白质集合均方位移直接相关，由此可以计算出集合的扩散系数。 可执行文件： PIPE.m-主程序输入数据作为文件夹路径或PIPE_read_2d_movie.m读取的Matlab矩阵。 在Matlab中运行：请参见文件标题中的示例。 PIPE_read_2d_movie.m-从原始数据文件创建数据矩阵。 默认情况下，不需要用户运行此脚本，但是可以为更高级的用法而运行。 分析核心： PIPE_calc_gaussian_widths.m-使每个强度轮廓适合高斯并提取其宽度。 PIPE_calc_D_of_expanding_gaussians.m-
【文件预览】：
PIPE-PhD
----PIPE_correct_baseline.m(1KB)
----PIPE_define_1d_profile_mask.m(4KB)
----PIPE_detect_pulse_end.m(2KB)
----PIPE_find_pulse_center.m(4KB)
----PIPE_identify_cell.m(1KB)
----PIPE_read_2d_movie.m(5KB)
----PIPE_correct_immobile_fraction.m(881B)
----PIPE_calc_D_of_expanding_gaussians.m(5KB)
----license.txt.rtf(2KB)
----PIPE_reduce_n_time_points.m(2KB)
----PIPE_calc_gaussian_widths.m(9KB)
----PIPE_find_min_distance_to_boundary.m(1KB)
----PIPE.m(8KB)
----PIPE_estimate_width0.m(1KB)
----PIPE_calc_time_points_by_noise_analysis.m(5KB)
----README.md(2KB)
----PIPE_smooth_with_gaussian_kernel.m(2KB)
----PIPE_apply_profile_mask.m(2KB)
----PIPE_find_phoc_peak.m(2KB)