文件名称:mwgAlignAnalysis:多全基因组比对测试套件
文件大小:38KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-07-11 11:50:12
Python
mwg对齐分析 (c) 2011-2012 作者,详见 LICENSE.txt。 作者 [Dent Earl] ( ) 概括 [Alignathon] ( ) 是全基因组比对者之间的合作项目,旨在帮助评估方法并促进该领域的发展。 该存储库用于对测试包中的预测对齐进行分析。 依赖关系 运行分析管道的 Linux 系统 Python 2.7 [mafTools] ( ) 安装 安装依赖项。 $ git clone $ cd mwgAlignAnalysis && make 用 从 [Alignathon 网站] ( ) 下载包后,执行对齐并将预测的 maf 放在package/predictions/ ,可以使用 $ make analysis location=/path/to/package set=testSet 其中location是包的路径, set是注册表目录中的前
【文件预览】:
mwgAlignAnalysis-master
----registries()
--------primateSet.reg.tab.template(3KB)
--------mammalSet.reg.tab.template(4KB)
--------testSet.reg.tab.template(4KB)
--------flySet.reg.tab.template(4KB)
----.gitignore(114B)
----Makefile(2KB)
----README.md(1KB)
----LICENSE.txt(1KB)
----evaluations()
--------src()
--------Makefile(297B)
--------README.md(2KB)