【文件属性】：
文件名称：mwgAlignAnalysis:多全基因组比对测试套件
文件大小：38KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-06-21 18:03:32
Python
mwg对齐分析
(c) 2011-2012 作者，详见 LICENSE.txt。
作者
[Dent Earl] ( )
概括
[Alignathon] ( ) 是全基因组比对者之间的合作项目，旨在帮助评估方法并促进该领域的发展。 该存储库用于对测试包中的预测对齐进行分析。
依赖关系
运行分析管道的 Linux 系统
Python 2.7
[mafTools] ( )
安装
安装依赖项。
$ git clone
$ cd mwgAlignAnalysis && make
用
从 [Alignathon 网站] ( ) 下载包后，执行对齐并将预测的 maf 放在package/predictions/ ，可以使用
$ make analysis location=/path/to/package set=testSet
其中location是包的路径， set是注册表目录中的前
【文件预览】：
mwgAlignAnalysis-master
----registries()
--------primateSet.reg.tab.template(3KB)
--------mammalSet.reg.tab.template(4KB)
--------testSet.reg.tab.template(4KB)
--------flySet.reg.tab.template(4KB)
----.gitignore(114B)
----Makefile(2KB)
----README.md(1KB)
----LICENSE.txt(1KB)
----evaluations()
--------src()
--------Makefile(297B)
--------README.md(2KB)