文件名称:gms7930:调控基因组测序
文件大小:31.24MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-14 10:32:35
HTML
这个Github项目包含GMS7930的课程材料:ChIP-seq数据分析实践。 我们在此类中使用Rmarkdown文件来演示我们的数据分析模块。 在此项目中,所有用于演示的ChIP-seq测序读取均作为BAM文件存储在数据文件夹中,而rmarkdown文件( gms7930-rgs.Rmd )及其输出文件( gms7930-rgs.html )位于项目根目录中文件夹。 要打开并运行Rmarkdown文件,必须先安装rstudio 。 确保您的计算机上安装了最新的R发行版本。 另外,如果rstuio不在Mac或Linux系统上运行,则在开始之前,需要对gms7930-rgs.Rmd文件进行一次编辑:必须将第78行上的workdir值更改为系统兼容的文件路径,例如'C:在Windows系统上。 另外,如果您在Windows上运行rstudio,请确保以系统管理员身份运行它。 完成上述所
【文件预览】:
gms7930-master
----gms7930-rgs-windows.Rmd(14KB)
----data()
--------Gm12878Ctcf.bam.bai(58KB)
--------Gm12878Ctcf.bam(3.42MB)
--------Gm12878Control.bam.bai(58KB)
--------preloadforwindows.rda(34.96MB)
--------Gm12878Control.bam(2.9MB)
----gms7930-rgs.Rmd(14KB)
----gms7930-rgs.html(1.46MB)
----README.md(1KB)
----gms7930-rgs-windows.html(1.46MB)