文件名称：grape-nf:使用Nextflow的自动RNA-seq管道
文件大小：3.63MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-08 08:16:22
rna-seq pipeline nextflow ngs crg
葡萄 Grape提供了广泛的RNA-Seq分析渠道。 它允许创建自动化和集成的工作流程来管理和分析RNA-Seq数据。 它使用作为执行后端。 请查看以获取更多信息。 在IHEC联盟中，Grape已被用于RNA-seq整合分析。 根据IHEC建议，检查以运行管道。 要求 类似于Unix的操作系统（Linux，MacOS等） Java 8 或引擎 快速开始 使用以下命令安装Nextflow： curl -s https://get.nextflow.io | bash 进行测试运行： nextflow run guigolab/grape-nf -with-docker 注意：第一次执行它时，将需要几分钟的时间从该GitHub存储库中下载管道，并需要执行管道所需的相关Docker映像。 管道软件 运行管道的首选方法是使用Docker或Singularity来提供执行所需的程序