【文件属性】：
文件名称：grape-nf:使用Nextflow的自动RNA-seq管道
文件大小：3.63MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-19 14:29:42
rna-seq pipeline nextflow ngs crg
葡萄
Grape提供了广泛的RNA-Seq分析渠道。 它允许创建自动化和集成的工作流程来管理和分析RNA-Seq数据。
它使用作为执行后端。 请查看以获取更多信息。
在IHEC联盟中，Grape已被用于RNA-seq整合分析。 根据IHEC建议，检查以运行管道。
要求
类似于Unix的操作系统（Linux，MacOS等）
Java 8
或引擎
快速开始
使用以下命令安装Nextflow：
curl -s https://get.nextflow.io | bash
进行测试运行：
nextflow run guigolab/grape-nf -with-docker
注意：第一次执行它时，将需要几分钟的时间从该GitHub存储库中下载管道，并需要执行管道所需的相关Docker映像。
管道软件
运行管道的首选方法是使用Docker或Singularity来提供执行所需的程序