文件名称：CUTRUN_Nextflow：使用Nextflow构建的CUT＆RUN-seq分析管道
文件大小：340KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-05 12:10:50
Nextflow
CUTRUN_Nextflow 使用Nextflow构建的CUT＆RUN-seq分析管道。 短读修整和对齐过程基于以下论文： MACS2和可用于调用峰值。 流程图 用法 $nextflow run khigashi1987/CUTRUN_Nextflow -r main --help N E X T F L O W ~ version 20.10.0 Launching ` ./main.nf ` [nice_pasteur] - revision: 48ae873b6f Usage: The typical command for running the pipeline is as follows: nextflow run khigashi1987/CUTRUN_Nextflow --input ./samples.csv --adapter /p
【文件预览】：
CUTRUN_Nextflow-main
----samples.csv(135B)
----docker()
--------Dockerfile(1KB)
--------environment.yml(543B)
--------run_docker_build.sh(59B)
----flowchart.png(381KB)
----nextflow.config(1KB)
----LICENSE(1KB)
----main.nf(24KB)
----assets()
--------multiqc()
--------multiqc_config.yml(2KB)
----run_nextflow.sh(664B)
----README.md(3KB)