文件名称：PyBNF:使用元启发式算法拟合系统生物学模型的应用
文件大小：1.8MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-19 23:31:40
Python
PyBioNetFit (PyBNF) 是一个通用程序，用于参数化使用 BioNetGen 基于规则的建模语言 (BNGL) 或系统生物学标记语言 (SBML) 指定的生物模型。 PyBioNetFit 提供了一套用于参数优化的并行元启发式算法（差分进化、粒子群优化、散射搜索）。 除了模型参数化之外，PyBNF 还支持通过引导或贝叶斯方法和模型检查来量化不确定性。 PyBNF 包括生物特性规范语言 (BPSL)，用于定义用于参数化或检查的定性数据。 它可以在大多数 Linux 和 macOS 工作站以及计算集群上运行。 有关文档，请参阅或的在线文档。 PyBioNetFit 是在 BSD-3 许可下发布的。 有关更多信息，请参阅 。 LANL 代号：C18062