文件名称:suite2p:钙成像记录中的细胞检测
文件大小:26.56MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-03-10 05:16:15
neuroscience data-analysis imaging JupyterNotebook
Suite2p 用于处理双光子钙成像数据的管道。 版权所有(C)2018 Howard Hughes Medical Institute Janelia Research Campus suite2p包含以下模块: 登记 细胞检测 峰值检测 可视化GUI 该代码由Carsen Stringer和Marius Pachitariu编写。 要获得支持,请打开一个。 参考文件在。 反卷积算法是基于,其设置基于 。 有关GUI演示,请参见此twitter。 您可以找到matlab版本。 请注意,该算法较旧,在非圆形ROI上效果不佳。 有关suite2p的工作原理的演讲,请。 阅读位于的文档 安装 安装Python的发行版-选择Python 3.x和您的操作系统。 请注意,如果未将anaconda添加到路径,则可能需要使用anaconda提示符。 从资源库下载文件。 您可以通过克隆存