VariantWorks:基于深度学习的变体调用工具包-https

时间:2021-03-09 08:21:12
【文件属性】:
文件名称:VariantWorks:基于深度学习的变体调用工具包-https
文件大小:2.68MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-03-09 08:21:12
deep-learning genomics variant-calling polishing Python VariantWorks SDK VariantWorks是一个框架,可用于开发基于深度学习的基因组读取处理任务,例如变体调用,共识调用等。它提供了通常适用于读取处理的数据编码和解析功能库,以及一种简单的插入方法进入深度学习管道。 对于深度学习管道,VariantWorks利用框架,该框架提供了易于使用的基于图形的高级计算图表示。 VariantWorks的目标受众如下: Variant Caller开发人员-对于Variant调用社区中的现有开发人员,VariantWorks打算提供一种方便的方法来开始设计使用深度学习构建的Variant调用程序。 深度学习从业人员-对于现有的深度学习从业人员,VariantWorks可以降低将新颖的深度学习技术应用于基因组变异调用领域的障碍。 核心功能 编码器-用于读取的预编写的,常用的编码器(将来会进行优化)。 I / O-通用基因组文件

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