文件名称：SpliceAI:基于深度学习的工具，可识别剪接变体
文件大小：15.96MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-02 02:28:09
Python
SpliceAI：一种基于深度学习的工具，可识别剪接变体 如所述，该软件包注释了遗传变异及其对剪接的预测作用。 更新：基因中所有可能的替换，1个碱基插入和1-4个碱基缺失的注释可下载。 这些注释对于学术和非营利性组织都是免费的； 其他用途需获得Illumina，Inc.的商业许可。 安装 安装SpliceAI的最简单方法是通过pip或conda： pip install spliceai # or conda install -c bioconda spliceai 或者，可以从安装SpliceAI： git clone https://github.com/Illumina/SpliceAI.git cd SpliceAI python setup.py install SpliceAI需要tensorflow>=1.2.0 ，最好通过pip或conda单独安装（有关其他安装选项
【文件预览】：
SpliceAI-master
----spliceai()
--------models()
--------utils.py(7KB)
--------__init__.py(174B)
--------__main__.py(3KB)
--------annotations()
----examples()
--------input.vcf(1KB)
--------output.vcf(2KB)
----LICENSE(193B)
----COPYRIGHT(2KB)
----setup.py(1KB)
----README.md(6KB)
----NOTICE(79KB)
----tests()
--------__init__.py(0B)
--------test_delta_score.py(2KB)
--------data()
----.gitignore(58B)