文件名称：ChemBLAST:BLASTing 化学库相似性搜索
文件大小：74.74MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-23 15:14:08
Java
化学爆破 BLASTing 化学库相似性搜索 用法 a) 格式化输入数据库 sh format.sh data/database.txt b) 相似度搜索 sh search.sh data/database.txt "C C(O)=O" 参考： 1) Baldi P. and Benz RW. BLASTing small molecules—statistics and extreme statistics of chemical similarity scores: Bioinformatics. Jul 1, 2008; 24(13): i357–i365. 2) Altschul SF, et al. Gapped blast and psiblast: a new generation of protein database search program
【文件预览】：
ChemBLAST-master
----bin()
--------README.TXT(1KB)
--------ChemBlast.jar(10KB)
--------lib()
----format.sh(87B)
----data()
--------database.txt.zip(754B)
--------chembl_19.txt.zip(24.91MB)
--------MalariaData_compound.txt.zip(4.41MB)
----ChemBlast()
--------build.xml(3KB)
--------manifest.mf(82B)
--------src()
--------nbproject()
----lib()
--------cdk-1.5.9-SNAPSHOT.jar(24.64MB)
--------FPSimBlast.jar(95KB)
----README.md(615B)
----search.sh(125B)