文件名称：mongodb-chemistry:MongoDB 中化学相似性搜索的想法
文件大小：86KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-16 00:45:47
python search mongodb chemistry cheminformatics
MongoDB 化学 MongoDB 中的化学相似性搜索实现，以及性能分析。 有关更多信息，请参阅。 也可以看看： （，） 安装 Mac OS X brew install rdkit mongodb pip install git+https://github.com/mcs07/mongodb-chemistry.git Ubuntu 请参阅 。 用法 一个简单的例子： mchem load mymols.sdf mchem addfp mchem countfp mchem similar O=C(Oc1ccccc1C(=O)O)C 有关更详细的示例，请参阅 。
【文件预览】：
mongodb-chemistry-master
----setup.py(1KB)
----mchem()
--------plot.py(9KB)
--------__init__.py(533B)
--------fps.py(4KB)
--------cli.py(13KB)
--------screening.py(4KB)
--------build.py(3KB)
--------similarity.py(5KB)
--------profile.py(1KB)
--------postgres.py(6KB)
----requirements.txt(99B)
----data()
--------sample_chembl_1000.txt(13KB)
----LICENSE(1KB)
----scripts()
--------postgres.sh(3KB)
--------pubchem.sh(996B)
--------chembl.sh(2KB)
--------bootstrap.sh(717B)
----README.md(1KB)
----img()
--------folding.svg(38KB)
--------screening.svg(39KB)
--------bench.svg(31KB)
--------postgres.svg(43KB)
--------hist.svg(66KB)
--------fps.svg(39KB)
--------radius.svg(39KB)