文件名称：atlas_gatk4:在Atlas HPC上测试gatk4模块
文件大小：16KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-27 01:35:17
gatk4 HTML
Atlas HPC上的GATK4模块 在Atlas HPC上测试gatk4模块 示例数据集 重用GATK nextflow管道中的数据集（ ） wget https://iastate.box.com/shared/static/wt85l6s4nw4kycm2bo0gpgjq752osatu.gz tar -xf wt85l6s4nw4kycm2bo0gpgjq752osatu.gz ls -1 test-data/ #> fastq # <= folder of paired reads #> read-group.txt #> ref # <= folder containing one genome reference 加载并链接GATK模块 （1）加载盖特克模块 salloc -A isu_gif_vrsc module load si
【文件预览】：
atlas_gatk4-main
----04_GATK.nf(11KB)
----nextflow.config(87B)
----timeline_report.html(47KB)
----README.md(8KB)
----submit.slurm(2KB)