american-gut-analyses

时间:2024-05-31 14:11:56
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更新时间:2024-05-31 14:11:56

JupyterNotebook

美国肠道项目的分析笔记本和代码 ipynb包含可执行的Jupyter笔记本。 ipynb/env描述了这些笔记本的ipynb/env和运行环境。 non-ipynb包含在Jupyter笔记本之外执行的分析。 手稿 与该存储库关联的是开放访问的,并在mSystems下发布。 如果使用此存储库中的代码或American Gut的数据,请考虑引用此手稿。 资料存取 American Gut Project的数据可以通过几种方式访问​​,并在下面简要介绍。 这是一个有生命的项目,因此除了固定数据集之外,这些数据集将继续增长。 固定的数据集对应于手稿所使用的内容。 所有序列和元数据都在项目下的EBI中。 此数据集不是固定的。 所有序列,元数据和已处理的摘要都可以从以研究ID 10317获得。该数据集不是固定的。 通过使用qiita_study_id==10317查询可以获得16S和元数据。


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