文件名称：ericscript:嵌合转录本发现
文件大小：1.1MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-06 03:23:33
R
EricScript自述文件v2.1（2016年2月） 如果您有任何疑问或问题，请随时给作者发送电子邮件。 matteo.benelli AT gmail.com 信息 EricScript是使用R，perl和bash脚本开发的软件包。 EricScript使用BWA对齐器在转录组参考上执行映射，并使用samtools处理SAM / BAM文件。 外显子结合点参考的重新校准通过使用BLAT进行。 要求 下载并安装R： : 下载并安装“ ada” R软件包： : 下载并安装BWA： 下载并安装SAMtools（> 0.1.17）： 下载并安装bedtools（> 2.15）： 下载并安装BLAT二进制文件： ://genome-test.cse.ucsc.edu/~kent/exe/下载并安装seqtk： : 确保所有这些程序都包含在PATH中。 奔跑的埃里克 下载EricScri
【文件预览】：
ericscript-master
----Dockerfile(1KB)
----LICENSE(34KB)
----ericscript-0.5.5.tar.bz2(499KB)
----cwl()
--------apps()
----.gitignore(48B)
----lib()
--------data()
--------perl()
--------R()
--------bash()
--------demo()
----README.md(3KB)
----ericscript.pl(214KB)