ericscript:嵌合转录本发现

时间:2021-05-17 09:36:53
【文件属性】:
文件名称:ericscript:嵌合转录本发现
文件大小:1.1MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-17 09:36:53
R EricScript自述文件v2.1(2016年2月) 如果您有任何疑问或问题,请随时给作者发送电子邮件。 matteo.benelli AT gmail.com 信息 EricScript是使用R,perl和bash脚本开发的软件包。 EricScript使用BWA对齐器在转录组参考上执行映射,并使用samtools处理SAM / BAM文件。 外显子结合点参考的重新校准通过使用BLAT进行。 要求 下载并安装R: : 下载并安装“ ada” R软件包: : 下载并安装BWA: 下载并安装SAMtools(> 0.1.17): 下载并安装bedtools(> 2.15): 下载并安装BLAT二进制文件: ://genome-test.cse.ucsc.edu/~kent/exe/下载并安装seqtk: : 确保所有这些程序都包含在PATH中。 奔跑的埃里克 下载EricScri
【文件预览】:
ericscript-master
----Dockerfile(1KB)
----LICENSE(34KB)
----ericscript-0.5.5.tar.bz2(499KB)
----cwl()
--------apps()
----.gitignore(48B)
----lib()
--------data()
--------perl()
--------R()
--------bash()
--------demo()
----README.md(3KB)
----ericscript.pl(214KB)

网友评论