文件名称：merqury:基于k-mer的装配体评估
文件大小：3.98MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-04 05:23:15
Shell
商品 使用k-mers等评估基因组装配 通常，基因组组装项目会提供可用于组装个体的全基因组测序读数。 该阅读集的k-mer光谱可用于独立评估装配质量，而无需使用高质量参考。 为此，Mercqury提供了一组工具。 相依性 gcc 7.4或更高版本（用于安装meryl） Java运行时环境（JRE） 带argparse，ggplot2和刻度的R（推荐R 4.0.3+） 床具 samtools 请注意，不再使用igvtools。 .tdf文件已替换为.wig文件，与IGV和UCSC基因组浏览器兼容。 安装 稳定释放 直接安装 在您的路径中获取有效的 下载meryl版本： ： tar -xJf meryl-1.3. * .tar.xz cd meryl-1.3/bin export PATH= $pwd : $PATH 如果二进制文件不起作用，请下载源代码并进行编译： cd