文件名称：psearch:基于3D配体的药效团建模
文件大小：2.56MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-28 09:20:48
Python
PSearch-基于3D配体的药效团建模 PSearch是生成基于3D配体的药效团模型并对其进行虚拟筛选的工具。 安装 pip install psearch 相依性 pmapper >= 0.3.1 例子 建立基于配体的药效团模型 建议创建一个空目录，该目录将是您的$PROJECT_DIR并将输入文件复制到该位置。 药效团模型生成有两个步骤。 数据集准备。 prepare_datatset - i $ PROJECT_DIR / input . smi - c 4 -i输入文件的路径-c要使用的CPU数量还有其他一些可以使用的参数。 使用-h键调用脚本以获取完整信息。 该脚本以一个制表符分隔的SMILES文件作为输入，该文件包含SMILES ， compound id ， activity列而没有标题。 第三列应包含一个字active或inactive 。 该脚本在活性和非活性