文件名称：GBS-SNP-CROP:GBS SNP呼叫参考可选管道
文件大小：1.66MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-11 13:58:49
Perl
GBS-SNP-CROP 最新版本v.4.1（2019年10月6日） 介绍 在GBS SNPÇ阿灵- [R eferenceöptional P ipeline（GBS-SNP-CROP）经由的顺序的顺序执行集成了定制解析和过滤用公知的，核实生物信息学工具程序，给用户完全访问所有中间文件。 通过采用基于个体内到跨种群多态性模式对应关系的变体（SNP和插入缺失）调用的新策略，该流水线能够从测序和PCR错误中识别和区分高可信变体，无论是没有参考基因组可用。 在后一种情况下，管道将采用聚类策略，使用相同的GBS数据来构建针对人群的“模拟参考”，以用于下游调用和基因分型。 GBS-SNP-CROP设计用于任意长度的双端（PE）或单端（SE）读取的库，通过消除由于强加的长度均匀性要求而导致的不必要的数据剔除，最大限度地提高了数据使用率。 GBS-SNP-CROP是一条完整的生物信息学流水线，主要用于