TRTools:用于全基因组串联重复序列分析的工具包

时间:2024-06-09 21:56:22
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文件名称:TRTools:用于全基因组串联重复序列分析的工具包

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更新时间:2024-06-09 21:56:22

Python

TR工具 TRTools包括各种实用程序,可用于筛选,质量控制和分析在从下一代测序中进行基因分型的下游的串联重复序列。 它支持多种最新的基因分型工具(见下文)。 请参阅完整文档和示例。 如果您在工作中使用TRTools,请引用:Nima Mousavi,Jonathan Margoliash,Neha Pusarla,Shubham Saini,Richard Yanicky,Melissa Gymrek。 (2020)TRTools:用于串联重复序列的全基因组分析的工具包。 生物信息学。 ( ) 安装 随着conda conda install -c bioconda trtools 注意:Bioconda当前python 3.6和3.7版本,因此conda中所有TRTools支持。 如果您使用的是我们支持的其他版本的python(3.5或> = 3.8),请使用pip安装TRTo


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