ChromBarCode:PRISMR结合域的全基因组分析

时间:2024-03-17 23:04:51
【文件属性】:

文件名称:ChromBarCode:PRISMR结合域的全基因组分析

文件大小:45.85MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-03-17 23:04:51

Python

ChromBarCode 全基因组分析染色质折叠背后的结合域 项目脚本和数据的存储库。 所有代码都是用Python 3编写的。 数据文件夹包含全基因组分析的结果以及运行脚本所需的文件。


【文件预览】:
ChromBarCode-main
----.DS_Store(14KB)
----.gitattributes(66B)
----Statistical_analysis()
--------binding_domains_overlaps.py(2KB)
--------binding_domains_size.py(3KB)
--------README.md(121B)
----Modules()
--------README.md(100B)
--------Polymer.py(8KB)
--------__pycache__()
--------Tools.py(2KB)
--------Chroms_info.py(679B)
----Architectural_analysis()
--------most_abundant_domain.py(4KB)
--------domains_visualizer.py(3KB)
--------most_contributing_domain.py(2KB)
--------README.md(138B)
--------plot_most_contributing_matrix.py(997B)
----README.md(291B)
----Data()
--------.DS_Store(8KB)
--------ENCODE_accession_numbers.txt(3KB)
--------epigenetic_profiles()
--------README.md(1KB)
--------genomic_coordinates()
--------prismr_polymers()
--------epigenetic_classes()
----Epigenetic_analysis()
--------compute_correlation.py(5KB)
--------hierarchical_clustering.py(6KB)
--------other_factors_corr.py(6KB)
--------epi_classes_stats.py(4KB)
--------README.md(103B)
--------binding_domain_mapper.py(1KB)

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