metafast:快速元基因组分析工具包

时间:2024-06-11 03:48:58
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文件名称:metafast:快速元基因组分析工具包

文件大小:37.66MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-11 03:48:58

Java

MetaFast MetaFast (METAgenome FAST分析工具包)是一种工具包,用于计算大量的元基因组序列的统计信息并建立它们之间的距离矩阵。 作者: 软体: Sergey Kazakov和 , 俄罗斯圣彼得堡。 测试: Veronika Dubinkina和Alexandr Tyakht , 物理化学医学研究所,俄罗斯莫斯科。 想法,主管:德米特里·阿列克谢夫( Dmitry Alexeev) , 物理化学医学研究所,俄罗斯莫斯科。 可以在GitHub 上找到MetaFast文档。 这是它的简短版本。 内容 安装 要运行MetaFast,您需要安装JRE 1.6或更高版本,并且只有一个脚本– metafast.sh , metafast.bat或metafast.jar 。 您可以从GitHub'Releases 的最新稳定版本中下载它。 对于Linux和M


【文件预览】:
metafast-master
----.gitignore(27B)
----src()
--------algo()
--------stub.sh(2KB)
--------structures()
--------tools()
--------GUI.java(41KB)
--------stub.bat(1KB)
--------ToolsScanner.java(332B)
--------io()
--------Runner.java(3KB)
----LICENSE(1KB)
----logo.jpg(136KB)
----README.md(5KB)
----build.xml(11KB)
----lib()
--------args4j-2.0.21.jar(59KB)
--------itmo-assembler.jar(24.47MB)
--------itmo-assembler-src.jar(567KB)
--------batik()
----test_data()
--------meta_test_2.fa(58KB)
--------tinytest_B.fastq(154B)
--------meta_test_1.fa(209KB)
--------meta_test_matrix.txt(200B)
--------meta_test_heatmap.png(4KB)
--------tinytest_A.fastq(156B)
--------meta_test_3.fa(117KB)
----TOOLS(2KB)

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