文件名称:genomeAlignment:主要基于ucsc_tools的成对基因组比对
文件大小:1.22MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-23 01:30:50
Perl
基因组比对 主要基于ucsc_tools的成对基因组比对
【文件预览】:
genomeAlignment-master
----data()
--------chain_matrix()
--------lastz.para(709B)
--------ucsc.log()
--------chain.para(287B)
--------substitution_matrix()
----bin()
--------chainStitchId(118KB)
--------chainNet(494KB)
--------netSyntenic(112KB)
--------lastz(445KB)
--------lavToPsl(126KB)
--------twoBitToFa(295KB)
--------chainPreNet(121KB)
--------chainMergeSort(126KB)
--------faToTwoBit(218KB)
--------netChainSubset(125KB)
--------chainSwap(117KB)
--------chainAntiRepeat(226KB)
--------axtChain(304KB)
----LICENSE(18KB)
----scripts()
--------plotChain.pl(12KB)
--------doLastz.pl(9KB)
--------getChr.pl(1KB)
--------chainning.pl(4KB)
--------netting.pl(5KB)
----README.md(71B)
----ga_pipeline.pl(14KB)
----.config(679B)