文件名称：heinz-app:亨氏的 Cytoscape 3.x 应用程序
文件大小：527KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-29 04:15:55
Java
亨氏细胞景观应用程序 这是一个 Cytoscape 3.x 应用程序（插件），用于发现交互网络中差异表达基因的子网模块。 它为工具提供了一个接口，该工具实现了一种算法，该算法使用可统计解释的基因评分来找到可证明的最佳子网络。 它通过简单的客户端-服务器协议 ( ) 运行 Heinz 工具，因此不必在执行分析的计算机上安装 Heinz。 目前，它仍处于早期发展阶段。 作者 费德·谢弗 *·凯比尔 贡纳尔·W·克劳 安装 该应用程序使用打包。 如果安装了 Maven，则可以通过从下载（或克隆）包、在包的根目录中打开终端并执行命令mvn install从源代码构建应用程序。 然后 Maven 将在target/目录中创建一个名为 heinz-cytoscape-app- version .jar 的 JAR 文件。 构建应用程序后，只需将 JAR 文件移动或复制到$HOME/Cyto
【文件预览】：
heinz-app-master
----pom.xml(4KB)
----LICENSE(18KB)
----src()
--------main()
----fitBumModel.R(8KB)
----examples()
--------dlbcl_bum_fit_statistics.txt(170B)
--------dlbcl_nodes.txt(76KB)
--------README(283B)
--------dlbcl_cytoscape_session.cys(404KB)
--------dlbcl_edges.txt(178KB)
--------dlbcl_heinz_output-fdr001.txt(41KB)
----.gitignore(168B)
----README.md(3KB)