文件名称：Zika-RNAseq-Pipeline：开放的RNA-Seq数据分析管道教程，其中包含最近处理Zika病毒研究中的数据的示例
文件大小：3.1MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-02-25 01:08:48
rna-seq pipeline notebook jupyter-notebook bioinformatics-pipeline
开放的RNA-Seq数据分析管道教程，其中包含最近处理Zika病毒研究中的数据的示例 辰王和AVI Ma'ayan BD2K-LINCS数据协调和集成中心（DCIC）位于纽约西奈山的伊坎医学院，纽约州10029美国 出版物 Wang Z和Ma'ayanA。一个开放的RNA-Seq数据分析管道教程，其中包含最近处理Zika病毒研究[第1版； 裁判员：2批准]。 F1000研究2016，5 ：1574（doi： ） 浏览笔记本 要查看具有更丰富显示效果的IPython笔记本，请单击 交互式运行RNA-seq管道 我们创建了一个Docker映像（ ），其中包装了管道的所有依赖项（命令行工具，R
【文件预览】：
Zika-RNAseq-Pipeline-master
----Zika.ipynb(3.25MB)
----plots.py(3KB)
----img()
--------combined-dn_ChEA.png(173KB)
--------zika-drug-mimickers.png(465KB)
--------zika-drug-reversers.png(436KB)
--------combined-up_MGI4.png(159KB)
--------combined-dn_KEGG.png(172KB)
----analyze_fastq.sh(5KB)
----analyze_fastq_kallisto.sh(4KB)
----Dockerfile(2KB)
----normalize.R(2KB)
----Dockerfile.kallisto(1KB)
----RNAseq.py(18KB)
----analyze_sra.sh(6KB)
----requirements.txt(117B)
----.gitignore(65B)
----analyze_sra_kallisto.sh(5KB)
----.dockerignore(64B)
----README.md(3KB)
----notebook.sh(945B)
----README.dockerhub.md(3KB)