文件名称：matlabcopula代码-uqsa:不确定性量化(UQ)和灵敏度分析(SA)
文件大小：981KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-24 03:41:30
系统开源
matlab copula代码乌克萨 不确定性量化 (UQ) 和灵敏度分析 (SA) 此存储库中分发的代码实现了 Eriksson 和 Jauhiainen 等人（2018 年）在论文“贝叶斯分析结合全局敏感性分析应用于动态细胞内通路模型的不确定性量化、传播和表征”中提出的方法。 该代码在 GNU 通用公共许可证 v3.0 下分发。 UQ 文件夹包含运行不确定性量化方法的 R 脚本（ABC-MCMC with copulas）。 需要包 ks、VineCopula、MASS、R.utils 和 R.matlab（将输出数据保存到 MATLAB 兼容文件的最后一个包）。 要运行的主脚本称为 runABCMCMC-Phenotype123.R。 该脚本将使模型适合表型 1-3（如论文中所述），我们将其用作说明性测试用例。 结果数据也以 R 和 MATLAB 格式上传到文件夹中。 我们使用表型 4 作为我们的预测数据集来说明 SA 方法。 SA 文件夹包含运行全局敏感性分析的 MATLAB 脚本。 需要 2014a 之后的 MATLAB 版本。 要运行的主脚本称为 get_predictio
【文件预览】：
uqsa-master
----SA()
--------SSsolutionFigA.m(1KB)
--------plot_S_i.m(2KB)
--------get_predictions_do_SA.m(1KB)
--------SSsolutionFigC.m(4KB)
--------sensitivity_analyses.m(4KB)
--------SSsolutionFigB.m(2KB)
----UQ()
--------copulaFunctions.R(2KB)
--------ABCMCMCFunctions.R(3KB)
--------runABCMCMC-Phenotype123.R(8KB)
--------runModel.R(2KB)
--------Draws-Phenotype123-Scale1000.RData(474KB)
--------Draws-Phenotype123-Scale1000.mat(502KB)
--------loadTargets.R(1KB)
--------SSsolutions.R(5KB)
--------Targets()
--------PreCalibration.R(2KB)
--------ScoringFunction.R(1KB)
----LICENSE(34KB)
----README.md(2KB)