【文件属性】:
文件名称:psf的matlab代码-INSPR:全细胞和组织的原位PSF检索
文件大小:251.8MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-24 05:50:00
系统开源
psf的matlab代码INSPR(原位PSF检索)
原位点扩展函数检索(INSPR)工具箱作为随附的手稿软件进行分发:Fan
Xu,Donghan
Ma,Kathryn
P.
MacPherson,Liu
Liu,Ye
Bu,Yu
Wang,Yu
Tang,Cheng
Bi,Tim
Kwok,AlexanderA。
Chubykin,Peng
Yin,Sarah
Calve,Gary
E.
Landreth和Fang
Huang,“具有原位点扩散功能检索的全细胞和组织的三维纳米显微镜”(2020)
Nature
Methods
,17(5):531-540,
INSPR工具箱针对双平面和基于散光的设置而开发。
它直接从获得的单分子数据集中构建原位3D点扩散函数(PSF),并具有易于使用的用户界面,包括INSPR模型生成中3D单分子定位的所有步骤,基于瞳Kong的3D定位(同时支持具有三次样条实现和CPU版本的GPU),漂移校正,体积对齐以及超分辨率图像重建。
它还包含一个小的单分子数据集,供用户运行作为示例。
由于Github(<100
MB)的空间有限,我们缩小了单分子数据集。
支