【文件属性】:
文件名称:CeleScope:GEXSCOPE单细胞分析管道
文件大小:1.46MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-04-02 13:47:39
Python
CeleScope
GEXSCOPE单细胞分析管道中文文档(
要求
conda
吉特
最小32GB RAM(运行STAR Aligner)
安装
克隆回购
git clone https://github.com/singleron-RD/CeleScope.git
# If github is blocked
git clone https://gitee.com/singleron-rd/celescope.git
安装conda软件包
cd CeleScope
conda create -n celescope
conda activate celescope
conda install --file conda_pkgs.txt --channel conda-forge --channel bioconda --channel r --channel imperial-col