文件名称：Evaluating-genome-assembly:用于评估基因组组装的一些统计数据的计算
文件大小：3KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-22 12:16:23
Python
评估基因组组装 计算一些用于评估基因组组装的统计数据。 依赖项： numpy matplotlib 用法： import sys from matplotlib import pyplot from stats import AssemblyStatistics # the input contig file, in FASTA format. inputFile = sys.argv[1] out = AssemblyStatistics(inputFile) # L50 of the assembly l50 = out.L50() # N50 of the assembly n50 = out.N50() # size of th
【文件预览】：
Evaluating-genome-assembly-master
----README.md(1KB)
----fastaParsing.py(1KB)
----stats.py(4KB)