GATK HaplotypeCaller SNP Calling 自动化流程

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文件名称：GATK HaplotypeCaller SNP Calling 自动化流程

文件大小：7KB

文件格式：SH

更新时间：2021-04-02 11:51:49

GATK SNAP Calling

使用GATK进行 SNP Callling的自动化流程。基于GATK3.3以上版本的HaplotypeCaller标准流程进行，测试脚本以sra文件为最初输入，将读取文件见内的所有sra文件（视为同一个样本的数据），进行SNP Callin*生GVCF，然后用户可自行进行jointCall