文件名称：single-cell-pseudotime:估计单细胞RNA-seq数据中伪时间的算法概述
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更新时间：2024-05-21 03:14:37
bioinformatics rna-seq single-cell pseudotime-algorithms
单细胞RNA-seq伪时间估计算法 单细胞，许多算法。 此页面的目标是对许多算法进行分类，这些算法根据细胞的基因表达水平来估计细胞的伪时间。 此问题也称为单细胞轨迹推断或排序。 最终，它将包含方法名称，软件链接，手稿链接以及有关每种方法的特定优点的简短注释。 最初，它只是试图列出尽可能多的方法。 还包括一些未专门为RNA-seq设计的相关方法（例如，大规模细胞计数法）。 该列表还包括专门设计为将伪时态数据作为输入的方法。 最初的列表是由Anthony Gitter创建的，但是非常欢迎请求请求。 谢谢其他。 引文 安东尼·吉特（Anthony Gitter）。 单细胞RNA-seq伪时间估计算法。 2018. doi：10.5281 / zenodo.1297422 问题概述 伪时间估计问题可以非正式地表述为： 给出：从生物状态A转变为状态B的异质细胞集合的单细胞基因表达测量 返回值
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single-cell-pseudotime-master
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--------workflows()
----LICENSE(18KB)
----README.md(34KB)