加法器MATLAB代码-CRISPRori:克里斯普瑞

时间:2024-06-21 16:11:54
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文件名称:加法器MATLAB代码-CRISPRori:克里斯普瑞

文件大小:64.74MB

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更新时间:2024-06-21 16:11:54

系统开源

加法器MATLAB代码克里斯普瑞 用于模拟细菌的 DNA 复制、基因表达和细胞分裂的数值模拟程序。 在我们的论文中,我们报告了一项关于 DNA 在调控细胞生长稳态和资源分配中的作用的新发现。 有关此模型或实验验证的详细信息,请参阅我们的论文: DNA 和细胞大小之间的缩放控制细菌生长稳态和资源分配 该代码库包括已在 MATLAB R2020a 上测试过的数值模拟和数据分析的主要程序。 要开始模拟,请将整个存储库下载到本地目录,然后在终端中运行以下命令: cd ./scripts matlab -nosplash -nodesktop -r "IntegratedSimulation" 主要参数包括 dCas9 的浓度、dCas9 的目标、总时间和质粒拷贝数。 例如,如果你想用 dCas9 浓度为 50 的目标 R4 box,总时间为 600 分钟,GFP 编码的质粒数为 10,并返回 100 帧的谱系 GIF 来执行模拟,命令应该是: matlab -nosplash -nodesktop -r "IntegratedSimulation c_dCas9 50 dCas9_target


【文件预览】:
CRISPRori-main
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----scripts()
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--------IntegratedSimulation.m(8KB)
--------plotTable.m(592B)
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--------Reaction.m(2KB)
--------bacterialGenome.m(26KB)
----README.md(2KB)

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