【文件属性】:
文件名称:launch-ukbb-gwas:在UKBB中运行GWAS
文件大小:6KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-03-30 03:49:05
Shell
启动ukbb-gwas
在UKBB上的远程节点上运行GWAS
默认值
等级归一化定量结果
QuantOutcomeRankNorm =假
提取无关的人
doExtractUnrel = FALSE
最小等位基因计数以过滤最终结果并绘制图
minmac = 3
最小等位基因频率以过滤最终结果并绘制图
minmaf = 0
在bgen文件中运行关联测试时,最小插补得分可过滤变体
mininfo = 0.4
首次启动之前
请输入ssh ubuntu@hunt-ukbb-iaas-theem 密码是ubuntu 然后exit 然后输入ssh-copy-id ubuntu@hunt-ukbb-iaas-theem 密码是ubuntu
停止!!!
您真的需要这样做吗? GWAS使用大量的计算资源,并且许多预先计算的汇总统计信息可用于UK Biobank 请在此处检查摘要统计信息是否已可供下载:
【文件预览】:
launch-ukbb-gwas-main
----.gitignore(430B)
----time.log(41B)
----kill.sh(78B)
----ps.txt(700B)
----launch.sh(2KB)
----README.md(3KB)
----cpumem.sh(2KB)
----check_key.sh(1KB)