文件名称：UKBB_FINEMAP_targetgene
文件大小：35KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-09 01:00:38
R
通过距SNP的距离富集阳性对照基因 运行此脚本 导航到scripts /并使用以下参数运行1a_run_enrichments.sh（有序）： 第5列中具有p-val或log10 bf的SNP床/淀粉文件的路径。文件应该已经过过滤，以删除MHC和Missense SNP。 特性名称。 对应于trait_genes_key.txt中的第1列。 （必须完全匹配） “ -log10_P值”或“ log10_Bayes_factor”。 描述“ trait_snps”的第5列。 “ All_SNPs”，“ DHS_SNPs”或“ Trait-Specific_DHS_SNPs”。 描述第一个参数。 阳性对照基因txt文件的路径。 格式：一列基因ID 阳性对照集的名称。 对应于trait_genes_key.txt中的第2＆3列。 （必须完全匹配） 床/淀粉文件的路径，其基因ID在第4
【文件预览】：
UKBB_FINEMAP_targetgene-master
----.gitignore(74B)
----data()
--------all_enrichments.db.txt(158KB)
----scripts()
--------1b_enrichment_calculation.R(2KB)
--------trait_genes_key.txt(468B)
--------3_plot_dist_effect.R(5KB)
--------1a_run_enrichments.sh(3KB)
--------2_make_database.sh(231B)
----README.md(2KB)
----plots()
--------distance_effect.pdf(12KB)