文件名称：图像矩阵matlab代码-Toolbox-Romano-et-al:计算工具箱，用于分析神经元人群的钙成像数据
文件大小：550KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-12 14:41:06
系统开源
图像矩阵matlab代码工具箱 计算工具箱，用于分析神经元人群的钙成像数据 参见Romano等人的预印本《计算工具箱和分步指南》，以分析钙成像数据中的神经元种群动态，以获取指南和完整说明（doi.org/10.1101/103879）。 Romano等人（doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005526）在用于神经元种群动态分析的集成钙成像处理工具箱中对此工具箱进行了演示。 在Zebrafish Neuroethology Lab开发（） 安装 通过单击此GitHub存储库的“克隆或下载”，下载工具箱的最新版本。 2017年8月更新：由于GitHub bandwidht的限制，biorxiv预印本中描述的工具箱教程的测试数据集已移至此处：下载完成后，将“测试数据”文件夹解压缩并将其移至“ Toolbox-Romano-et” -al”文件夹从该GitHub存储库下载。 对于最近尝试直接从GitHub下载测试数据集的用户遇到的问题，我们深表歉意。 我们没有意识到用于从存储库下载数据集的Git LFS的带宽限制。 不久前已经超过了此限制，并且该项目的Git LFS自
【文件预览】：
Toolbox-Romano-et-al-master
----Toolbox software()
--------getline_adv.m(13KB)
--------SurrogateData.m(5KB)
--------getcurpt.m(671B)
--------mygaussfit.m(1KB)
--------plotOrder.m(207B)
--------rescalegd.m(322B)
--------CombineMultiPlane.m(1KB)
--------changeGamma.m(389B)
--------findArtifacts.m(12KB)
--------changeScale.m(278B)
--------HexaSegment.m(1KB)
--------SanityTest.m(4KB)
--------SmoothRegistration.m(7KB)
--------export_fig()
--------pValueSynch.m(1KB)
--------AssembliesDynamicsVisualization.m(5KB)
--------nanstats.m(2KB)
--------ProcessFluorescenceTraces.m(7KB)
--------lookForROI.m(244B)
--------Rasterize.m(1KB)
--------saveMap.m(587B)
--------NoiseModel.m(5KB)
--------boundedline()
--------MapResponses.m(6KB)
--------freezeColors.m(10KB)
--------FindROIs.m(49KB)
--------som_mdist.m(2KB)
--------AssembliesTopographicalOrganization.m(10KB)
--------SignificantOdds.m(932B)
--------changeContrast.m(407B)
--------getVideoFile.m(439B)
--------plotResponses.m(6KB)
--------subplotsqueeze.m(668B)
--------indexesAssemblies.m(3KB)
--------EstimateBaselineNoise.m(2KB)
--------runline.m(837B)
--------checkCells.m(4KB)
--------roipoly_adv.m(8KB)
--------remapResponseColors.m(4KB)
--------som_fillnans.m(1KB)
--------PlotROIResponses.m(4KB)
--------AssembliesActivations.m(2KB)
--------RunResponseMapping.m(390B)
--------db_index.m(2KB)
--------imoverlay.m(2KB)
--------AssembliesVsSurrogate.m(8KB)
--------unfreezeColors.m(4KB)
--------FindAssemblies.m(22KB)
----LICENSE(34KB)
----README.md(8KB)