SingleCellSeqCNV:通过单细胞测序检测拷贝数变化-开源

时间:2021-06-01 12:15:17
【文件属性】:
文件名称:SingleCellSeqCNV:通过单细胞测序检测拷贝数变化-开源
文件大小:280KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-06-01 12:15:17
开源软件 通过单细胞测序检测拷贝数变化 Kristin A. Knouse、Jie Wu 和 Angelika Amon,使用单细胞测序评估百万碱基规模的体细胞拷贝数变异。 基因组研究,2016 年。 198937.115 Kristin A Knouse、Jie Wu、Charles A Whittaker 和 Angelika Amon。 单细胞测序揭示了哺乳动物组织中低水平的非整倍性。 美国国家科学院院刊,2014. 111(37):13409-13414。
【文件预览】:
singlecellseqcnv-code-7ef01e3cf41b7e0b2c9916e173cb8abd0e2a5a07
----run_hmmcopy.hg19.r(3KB)
----HMMpipe.pl(5KB)
----mm9_gc_500k.wig(44KB)
----mm9.500k.dynamic.win.fa.gc.txt(168KB)
----normalizeGC.pl(2KB)
----mm9.500k.dynamic.win.bed(94KB)
----GenMapWin.pl(907B)
----hg19_map_40mer_500k.wig(52KB)
----run_hmmcopy.mm9.r(2KB)
----hg19.500k.dynamic.win.fa.gc.txt(187KB)
----findcoordinates.pl(935B)
----dnacopy.r(843B)
----hg19_gc_500k.wig(50KB)
----mm9_map_40mer_500k.wig(46KB)
----readme(968B)
----hg19.500k.dynamic.win.bed(105KB)
----getGCpercent.pl(352B)

网友评论